První kořeny vzniku naší školy sahají k roku 1966, kdy bylo zřízeno Odborné učiliště n.p. ČSAD České Budějovice. Tím byly položeny základy k vzniku dnešní instituce.

Teoretická výuka byla přestěhována do historické budovy ve Skuherského ulici č.p.3, České Budějovice. Během tří let se sem přestěhovalo celé ředitelství Odborného učiliště. Sídlo školy od té doby leží v blízkosti centra Českých Budějovic. S ním je spojena nejen geograficky, ale především svojí historií. Žilo a pracovalo zde několik významných osobností kraje. Na začátku 19. století zde žil vlastenecký biskup Jan Valerián Jirsík, který v blízkosti založil jedno z nejstarších a největších gymnázií. Na počátku 20. století tady prožil svůj bohatý život skladatel Zdeněk Skuherský, po němž je pojmenována celá ulice. Budova školy je v současnosti památkově chráněným objektem.

Další osamostatňující zlom přišel s rokem 1981, kdy Jihočeský krajský národní výbor, odbor dopravy, zřídil Střední odborné učiliště dopravní s organizačním začleněním do n.p. ČSAD České Budějovice. Tímto ustanovením byla již jasněji dána struktura školy jak ji dnes známe a jak se prezentuje na veřejnosti. Avšak byla neustále v úzkém propojení s jinými státními podniky.

Dne 1. 9. 1991 se Střední odborné učiliště dopravní stalo samostatně hospodařící jednotkou s právní subjektivitou. Se získáním právní subjektivity došlo k rozšíření a modernizaci Středního odborného učiliště a Střední odborné školy automobilní.